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健康科学研究院2014年度科研成果一览

一、科研项目

科研项目是健康院可持续发展的动力。健康院目前在研项目16项,纵向课题12项,横向课题4项。包括国家“973”项目子课题1项(张部昌)、国家自科基金6(葛宏华、夏俊峰、陈鹏、吴杭、张楠楠、祝小雷)、国际合作项目1项(葛宏华)、其他省部级及横向合作课题8项。除20149月以后到岗的杨兴元教授、秦曦明教授和李长润教授外,其他每位全职PI课题组都承担至少1项国家级项目。 特别说明的是张部昌教授主持的“973”项目“合成微生物体系的适配性研究”子课题已出色完成中期检查任务,将在后期追加课题经费,预期合同总经费将超过原先计划的100万元。

2014年,新增科研项目或经费如下:

1.    张部昌 国家“973”项目子课题“合成微生物体系的适配性研究”(编号2013CB734000,到账经费10万元)

2.    葛宏华 国际科技合作专项“面向食品病原体多重检测的SERS编码纳米传感器”(编号2014DFG42290,合同经费27.5万元,到账经费23万)

3.    张楠楠(葛宏华教授课题组) 国家自然科学基金“嗜肺军团菌RpoS调控II型分泌系统效应蛋白磷脂酶A分子机理的研究”(编号31400641,合同经费24万,到账经费14.4万,生命学院账面)

4.    祝小雷 国家自然科学基金“基于几何哈希算法的酶设计” (编号21403002,合同经费25万,到账经费15万元)

5.    夏俊峰 安徽省自然科学基金项目“蛋白质热点残基数据库构建及其预测方法研究”(编号1408085QF106,到账经费7万元)

6.    夏俊峰 留学人员科技活动项目择优资助经费(项目启动类) “基于蛋白质序列和结构信息的癌症驱动突变预测方法研究”(皖人社秘[2014]243号文件,到账经费3万元)

7.    开远忠(何成教授课题组)中国科学院脑功能与脑疾病重点实验室开放课题“视黄酸介导星状胶质细胞谷氨酸转运体表达与抑郁症发病关系研究”(2014-3,到账经费3万,生命学院账面)。

8.    唐恒立 毕红“澳锋生物技术研发中心项目”(横向课题,项目总经费200万元,到账经费50万元)

9.    张部昌 金种子人工窖泥快速培养工艺技术研究(金种子酒业合作课题,合同总经费150万,近期将到账100万)。

二、科研成果

1、申请专利4项,均已进入实审

(1)      张部昌,吴攀攀,吴杭,黄训端.一种通过糖多孢红霉菌SACE_3986基因提高红霉素产量的方法。中国发明专利,申请号:201410014348

(2)      戴维·威孚, 曹诚, 靳彦文, 米歇尔·瑞奇韦兹, 张部昌, 朱林, 贾茹, 姚溢, 温重政。抗CD20抗原的抗体L1H1及其应用。中国发明专利,申请号:201410121092.9

(3)      戴维·威孚, 王相芳, 曹诚, 靳彦文, 米歇尔·瑞奇韦兹, 张部昌, 朱林, 贾茹, 姚溢。抗CD20抗原的抗体L4H6及其应用。中国发明专利,申请号:201410122716.9

(4)      戴维·威孚, 杨凌, 曹诚, 靳彦文, 米歇尔·瑞奇韦兹, 张部昌, 朱林,贾茹, 姚溢。抗CD20抗原的抗体L5H6及其应用。中国发明专利,申请号:201410120367.7

2、学术论文

[1] 张部昌* Wu H, Mao YR, Chen M, Pan H, Huang XD, Ren M, Wu H, Li JL, Xu ZD, Yuan HL, Geng M, Weaver DT*, Zhang LX*, Zhang BC*. Capturing the target sequences of BldD in Saccharopolyspora erythraea using a revised SELEX method. Appl Microbiol Biotechnol. 2014 Dec 31. [Epub ahead of print].(JCR二区)

[2] 张部昌* Wu H, Chen M, Mao YR, Li WW, Liu JT, Huang XD, Zhou Y, Ye BC, Zhang LX*, Weaver DT*, Zhang BC*. Dissecting and engineering of the TetR family regulator SACE_7301 for enhanced erythromycin production in Saccharopolyspora erythraea. Microbial Cell Factories. 2014, 13: 158 (JCR二区)

[3] 张部昌 Wang Y, Zhang B, Zhu L, Li Y, Huang F, Li S, Shen Y, Xie A. Preparation and Multiple Antitumor Properties of  AuNRs/Spinach Extract/PEGDA Composite Hydrogel.ACS Appl Mater Interfaces. 2014,6(17):15000-6.(与化工学院谢安建教授课题组合作,JCR一区)

[4] 张部昌 Li Y, Li S, Ai G, Wang W, Zhang B, Yang K. Optimized sample preparation for metabolome studies on Streptomyces coelicolor. Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao. 2014 Apr;30(4):554-68. (与中科院微生物所杨克迁研究员课题组合作,PUBMED)

[5] 张部昌 Xu C, He X, Zheng Z, Zhang Z, Wei C, Guan K, Hou L, Zhang B, Zhu L, Cao Y, Zhang Y, Cao Y, Ma S, Wang P, Zhang P, Xu Q, Ling Y, Yang X, Zhong H. Downregulation of MicroRNA miR-526a by Enterovirus Inhibits RIG-I-Dependent Innate Immune Response. J Virol. 2014 Oct 1;88(19):11356-68.(与军事医科院钟辉研究员课题组合作,JCR二区)

[6] 张部昌 Ling Y, Zhang X, Bai Y, Li P, Wei C, Song T, Zheng Z, Guan K, Zhang Y, Zhang B, Liu X, Ma RZ, Cao C, Zhong H, Xu Q. Overexpression of Mps1 in colon cancer cells attenuates the spindle assembly checkpoint and increases aneuploidy. Biochem Biophys Res Commun. 2014 Aug 8;450(4):1690-5. (与军事医科院钟辉研究员课题组合作,JCR三区)

[7] 张部昌 Yao LL, Liao CH, Huang G, Zhou Y, Rigali S, Zhang B, Ye BC.GlnR-mediated regulation of nitrogen metabolism in the actinomycete Saccharopolyspora erythraea. Appl Microbiol Biotechnol. 2014 Sep;98(18):7935-48. (与华东理工大学叶邦策教授课题组合作,JCR二区)

[8] 张部昌* Wu P, Pan H, Zhang C, Wu H, Yuan L, Huang X, Zhou Y, Ye BC, Weaver DT, Zhang L, Zhang B..SACE_3986, a TetR family transcriptional regulator, negatively controls erythromycin biosynthesis in Saccharopolyspora erythraea. J Ind Microbiol Biotechnol. 2014 Jul;41(7):1159-67.(JCR二区)

[9] 张部昌 Zhang HM, Dai H, Hanson PJ, Li H, Guo H, Ye X, Hemida MG, Wang L, Tong Y, Qiu Y, Liu S, Wang F, Song F, Zhang B, Wang JG, Zhang LX, Yang D..Antiviral activity of an isatin derivative via induction of PERK-Nrf2-mediated suppression of cap-independent translation. ACS Chem Biol. 2014 Apr 18;9(4):1015-24.(与中科院微生物所张立新研究员课题组合作,JCR二区)

[10] 张部昌 Zhuo Y, Zhang T, Wang Q, Cruz-Morales P, Zhang B, Liu M, Barona-Gómez F, Zhang L.Synthetic biology of avermectin for production improvement and structure diversification. Biotechnol J. 2014 Mar;9(3):316-25. (与中科院微生物所张立新研究员课题组合作,JCR三区)

[11] 张部昌* Wei C, Cao Y, Yang X, Zheng Z, Guan K, Wang Q, Tai Y, Zhang Y, Ma S, Cao Y, Ge X, Xu C, Li J, Yan H, Ling Y, Song T, Zhu L, Zhang B, Xu Q, Hu C, Bian XW, He X, Zhong H.Elevated expression of TANK-binding kinase 1 enhances tamoxifen resistance in breast cancer. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Feb 4;111(5):E601-10. (与军事医科院钟辉研究员课题组合作,JCR一区)

[12] 葛宏华*  Yu D*, Chen X* ,Xu Z,Ge H. Crystallization and preliminary X-ray characterization of the dephospho-CoA kinase from Legionella pneumophila. Acta Cryst. (2014). F70, 608–610.(* co-first author)(JCR四区)

[13] 葛宏华* Gong X, Chen X, Yu D, Zhang N, Zhu Z, Niu L, Mao Y, Ge H*. Crystal structure of Legionella pneumophila dephospho-CoA kinase reveals a non-canonical conformation of P-loop. J Struct Biol. 2014;188(3):233-239(JCR三区)

[14] 夏俊峰*  Junfeng Xia, Peilin Jia, Katie Hutchinson, Kimberly B Dahlman, Johnson D, Jeffrey A Sosman, William Pao, and Zhongming Zhao. A meta-analysis of somatic mutations from next generation sequencing of 241 melanomas: a road map for the study of genes with potential clinical relevance. Molecular Cancer Therapy, 2014 Jul;13(7):1918-28(JCR二区)

[15] 夏俊峰* Shen B, Teschendorff AE, Zhi D, Xia J. Biomedical data integration, modeling, and simulation in the era of big data and translational medicine. Biomed Res Int.2014:731546. (JCR四区)

[16] 夏俊峰* Di, Y., Wang, C., Wu, H., Yu, X., and Xia, J.. Comparative Assessment of Data Sets of Protein Interaction Hot Spots Used in the Computational Method. In Intelligent Computing in Bioinformatics . Springer International Publishing ,2014 :478-486. (EI收录)

[17] 夏俊峰* Zhang, D., and Xia, J.. Potential Driver Genes Regulated by OncomiRNA Are Associated with Druggability in Pan-Negative Melanoma. In Intelligent Computing in Bioinformatics. Springer International Publishing 2014:315-321 (EI收录)

[18] 陈鹏* Chuan-XiLi, Ru-Jing Wang, Peng Chen*, He Huang, Ya-Ru Su. Interaction Relation OntologyLearning. Journalof Computational Biology:2014/1/1,21(1) ,80-88 (JCR四区)

[19] 陈鹏*Peng Chen, Jianhua Z Huang, Xin Gao, LigandRFs: random forest ensemble to identify ligand-binding residues from sequence information alone. BMC Bioinformatics,2014,15(S15), p:S4.(JCR三区)

[20] 陈鹏* Chengjun Xie, Jieqing Tan, Peng Chen*, Jie Zhang, Lei He, Collaborative object tracking model with local sparse representation. J Visual Communication and Image Representation ,2014,25(2): 423-434.(JCR三区)

[21] 陈鹏* Chengjun Xie, Jieqing Tan, Peng Chen*, Jie Zhang, Lei He, Multi-scale patch-based sparse appearance model for robust object tracking. Machine Vision and Applications, 2014,25(7): 1859-1876.(JCR三区)

[22] 吴杭 Zhang PP, Wu H, Chen XL, Deng ZX, Bai LQ, Pang XH. Regulation of the biosynthesis of thiopeptide antibiotic cyclothiazomycin by the transcriptional regulator SHJG8833 in Streptomyces hygroscopicus 5008. Microbiology. 2014 Jul;160(Pt 7):1379-1392(与上海交通大学白林泉教授课题组合作,JCR四区)

[23] 宾艳南 Bin Yannan, Jiang Zhongxiu, Xiang Juan. Applied Biochemistry and Biotechnology Side effect of Tris on the interaction of amyloid β-peptide with Cu2+: evidence for Tris-Aβ-Cu2+ ternary complex formation. Appl Biochem Biotech, Under Review.

[24] 宾艳南 Lui Mengmeng, Bin Yannan, Hou Yuting, Xiang Juan, Zhou Feimeng. Complicated function of dopamine in Abeta-related neurotoxicity: dual interactions with Tyr10 and SNK(26-28) of Abeta. ACS Chemical Neuroscience, Under Review.

[25] 徐晶晶,吴杭,孟思童,刘瑞华,黄训端,张部昌,白林泉。林可霉素转运蛋白基因lmrC的功能分析。上海交通大学学报(自然版),2014; 48(02): 159-163. (EI) (与上海交通大学白林泉教授课题组合作)

[26] 潘伦,毛永荣,陈萌,吴攀攀,袁莉,黄训端,吴杭,徐忠东,张部昌。metK、vhbS和adpA的串联表达提高红色糖多孢菌红霉素产量的研究。军事医学, 2014; 8: 608-611 (CSCD)

[27] 刘静,姜春艳,张部昌*,白林泉*. ABC转运蛋白基因slnTI和slnTII与盐霉素生物合成的相关性. 微生物学通报,2014,1:66-74 (CSCD)










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