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健康科学研究院2016年度科研成果一览

    一、科研项目

    健康研究院积极支持申报各类科研项目,鼓励科研人员积极与企业联系,寻求横向合作机会,服务地方。2016年,健康研究院在科研项目申报上,硕果累累:新增国家自科基金项目5项(健康研究院人均国家基金比例在学校名列前茅),安徽省自科基金项目1项,安徽省教育厅重点重大项目2项,人社部回国留学人员科技择优项目1项,人社厅回国留学人员科技择优项目1项,与企业合作横向课题4项等,全年总到账经费316.2万元。具体到账项目和经费情况如下。

    1. 张部昌 国家自然科学基金面上项目(31570074):糖多孢红霉菌TetR家族与红霉素合成相关转录因子的调控网络构建:2016.01-2019.12;直接经费68万;2016年到账3.4万

    2. 张部昌 国家973项目子课题(2013CB734000):合成微生物体系的适配性研究;起止时间:2013.01-2017.12;107万;2016年到账35.7万

    3. 张部昌 金种子酒业横向课题“金种子人工窖泥快速培养技术研究”项目;合同经费150万,2016年到账50万

    4. 张部昌  安徽天祥粮油“健康油脂研发” 项目。起止时间:2016.01-2020.12;合同经费:50万;2016年到账10万

    5. 张部昌 2011安徽省教育厅重点项目“食用菌汤料研制及汤品质量提升技术研究”,2016年到账1万

    6. 葛宏华 安徽省教育厅重点项目(Y06063009),2016年到账1万

    7. 夏俊峰 国家自然科学基金项目“癌症驱动突变的生物信息学分析和实验验证”,批准号61672037,2017.01-2020.12,2016年到账38.7万元

    8. 夏俊峰 与解放军电子工程学院合作课题“PPI数据采集与分析试验”(经费号:Y06099208),2016.01-2017.12,2016年到账21万元

    9. 陈鹏 国家自然基金青年基金“基于氨基酸序列协同进化编码的蛋白质热点残基预测”(基金号:61300058),2013.01-2016.12,2016年到账5万元

    10. 陈鹏 国家自然基金面上项目 “蛋白质-配体相互作用的深度学习自动编码和随机映射研究”(基金号:61672305),2017.01-2020.12,2016年到账32万元

    11. 秦曦明 安徽省自然科学基金面上项目“生物钟核心激酶Casein Kinase Iε的结构以及调控机制的研究”,2016.07-2018.06 ,2016年到账8万元。

    12. 秦曦明 国家自然科学基金面上项目“生物钟核心激酶Casein Kinase 1 ε调控机制的研究”,2016.01-2019.12, 2016年到账3万元。

    13. 杨兴元 国家人社部留学回国人员科技择优项目,2016年到账3万元

    14. 杨兴元 安徽省人社厅留学回国人员科技择优项目,2016年到账5万元

    15. 杨兴元 安徽省教育厅重点项目,2016年到账4.8万元

    16. 杨兴元 与企业横向课题“山西博超科技发展合作项目”,2016年到账55万元

    17. 李长润 安徽省教育厅重点项目,2016年到账6万元

    18. 宾艳南 国家基金青年项目“铜离子结合β淀粉样多肽在线粒体功能损伤中的作用机理研究”,2017.01-2019.12, 2016年到账12万

    19. 汪焰胜 国家自科基金青年项目“糖多孢红霉菌中与红霉素合成相关调控因子间的干扰机制研究”,2017.1-2019.12, 2016年到账11.4万元

    20. 徐昌志 国家自科基金青年项目“CHO细胞中靶向CYLD的miRNA筛选及其对抗体表达的影响”,2017.1-2019.12, 2016年到账12万元


    二、科研成果

    (一)学术论文

    健康研究院鼓励学科间相互合作拓展研究领域,鼓励科研人员发表高水平学术论文。由于这一年的努力工作,健康研究院科研人员在各自领域内取得了重要的进展。例如,张部昌教授课题组首次在产抗生素的放线菌中深入解析了Lrp蛋白对抗生素生物合成的调控机制,揭示了Lrp蛋白具有可双向调控的促进型配体和抑制型配体;葛宏华教授与中科院合肥物质院、芬兰于韦斯屈莱大学纳米科学中心、芬兰坦佩雷大学生物医学技术所的研究小组组成的国际联合研究团队,成功运用等离激元纳米技术实现对食源性致病菌的SERS高效检测,等等。据统计,2016年健康研究院科研人员共发表学术论文31篇,其中JCR一区论文9篇。具体如下:

    1. 张部昌 Liu J, Chen Y, Wang W, Ren M, Wu P, Wang Y, Li C, Zhang L, Wu H, Weaver DT4, Zhang B. Engineering of an Lrp family regulator SACE_Lrp improves erythromycin production in Saccharopolyspora erythraea. Metab Eng. 2016 Oct 26. pii: S1096-7176(16)30186-0. doi: 10.1016/j.ymben.2016.10.012. [Epub ahead of print](JCR一区,通讯作者)

    2. 张部昌 Hang Wu, Yansheng Wang, Li Yuan, Yongrong Mao, WeiweiWang, Lin Zhu, Panpan Wu, Chengzhang Fu, Rolf Muller, David T.Weaver, Lixin Zhang*, Buchang Zhang*. Inactivation of SACE_3446, a TetR family transcriptional regulator, stimulates erythromycin production in Saccharopolyspora erythraea. Synthetic and Systems Biotechnology. 2016, 1(1): 39-46.(通讯作者,创刊号上发表)

    3. 张部昌 Guo J, Wang C, Han Y, Liu Z, Wu T, Liu Y, Liu Y, Tan Y, Cai X, Cao Y, Wang B, Zhang B, Liu C, Tan S, Zhang T. Identification of Lysine Acetylation in Mycobacterium abscessus Using LC-MS/MS after Immunoprecipitation. J Proteome Res. 2016 Aug 5;15(8):2567-78. (JCR二区,与中科院广州生物医药与健康研究院张天宇研究员课题组合作)

    4. 张部昌 Makafe GG, Cao Y, Tan Y, Julius M, Liu Z, Wang C, Njire MM, Cai X, Liu T, Wang B, Pang W, Tan S, Zhang B, Yew WW, Lamichhane G, Guo J, Zhang T. Role of the Cys154Arg Substitution in Ribosomal Protein L3 in Oxazolidinone Resistance in Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob Agents Chemother. 2016 Apr 22;60(5):3202-6(JCR二区,与中科院广州生物医药与健康研究院张天宇研究员课题组合作)

    5. 徐昌志 David Weaver博士 张部昌 Xu C, Yang L, Yuan Y, Du F, Wang S, Wang X, Zhu L, Zhang B, Weaver D. Up-Regulation of Cyld Enhances Listeria Monocytogenes Induced Apoptosis in Thp-1 Cells[J]. Microb Pathog, 2016, 90: 50-54.(JCR四区)

    6. David Weaver博士Yang Y, Zhu L, Xia F, Gong B, Xie A, Li S, Huang F, Wang S, Shen Y, Weaver DT.  A Novel 5-FU/rGO/Bce Hybrid Hydrogel Shell on Tumor Cell: One-step Synthesis and Synergistic Chemo/photothermal/photodynamic Effect[J]. RSC Advances, 2016.(已接收)

    7. 张部昌Ning P, Jiang J, Li L, Wang S, Yu H, Feng Y, Zhu M, Zhang B, Yin H, Guo Q, Meng X. A mitochondria-targeted ratiometric two-photon fluorescent probe for biological zinc ions detection. Biosens Bioelectron. 2016 Mar 15;77:921-7(JCR一区,与化工学院孟祥明教授合作)

    8. 葛宏华 Wang W, Hynninen V, Qiu L, Zhang A, Lemma T, Zhang N, Ge H*, Toppari J*, Hytonen V, Wang J*. Synergistic enhancement via plasmonic nanoplate-bacteria-nanorod supercrystals for highly efficient SERS sensing of food-borne bacteria. Sensors and Actuators B: Chemical. 2017, 239:515-525(JCR一区,通讯作者)

    9. 葛宏华 秦曦明Zhang N, Gong X, Lu M, Chen X, Qin X, Ge H*. Crystal structures of Apo and GMP bound hypoxanthine-guanine phospho-ribosyltransferase from Legionella pneumophila and the implications in gouty arthritis. J Struct Biol.2016,194(3):311-6(JCR三区,葛宏华为通讯作者)

    10. 葛宏华 Qiu L, Wang W, Zhang A, Zhang N, Lemma T, Ge H, Toppari JJ, Hytönen VP, Wang J.Core-Shell Nanorod Columnar Array Combined with Gold Nanoplate-Nanosphere Assemblies Enable Powerful In Situ SERS Detection of Bacteria. ACS Appl Mater Interfaces. 2016 Sep 21;8(37):24394-403.(JCR一区,与中国科学院合肥物质院王进研究员合作)

    11. 夏俊峰 Ran Wei, Yao Yao, Wu Yang, Chun-Hou Zheng, Min Zhao, and Junfeng Xia, dbCPG: A web resource for cancer predisposition genes, Oncotarget, 2016, 7(25): 37803-37811(JCR一区,通讯作者)

    12. 夏俊峰 Pengbo Wen, Peng Xiao, and Junfeng Xia. dbDSM: a manually curated database for deleterious synonymous mutations, Bioinformatics, 2016, 32(12): 1914-1916(JCR一区,通讯作者)

    13. 夏俊峰 Xia J, Yue Z, Di Y, Zhu X, Zheng CH. Predicting hot spots in protein interfaces based on protrusion index, pseudo hydrophobicity and electron-ion interaction pseudopotential features. Oncotarget. 2016 Apr 5;7(14):18065-75(JCR一区,第一作者)

    14. 夏俊峰 Zhang D, Chen P, Zheng CH, Xia J. Identification of ovarian cancer subtype-specific network modules and candidate drivers through an integrative genomics approach. Oncotarget. 2016 Jan 26;7(4):4298-309(JCR一区,通讯作者)

    15. 夏俊峰 Ran Wei, Ming Zhao, Chun-Hou Zheng, Min Zhao, and Junfeng Xia, Concordance between somatic copy number loss and down-regulated expression: A pan-cancer study of cancer predisposition genes, Scientific Reports, 2016,6:37358(JCR二区,通讯作者)

    16. 夏俊峰Du X, Sun S, Hu C, Li X, Xia J. Prediction of protein-protein interaction sites by means of ensemble learning and weighted feature descriptor. J Biol Res (Thessalon). 2016 Jul 4;23(Suppl 1):10.(通讯作者)

    17. 夏俊峰 Shang J, Sun Y, Liu JX,4, Xia J, Zhang J, Zheng CH. CINOEDV: a co-information based method for detecting and visualizing n-order epistatic interactions. BMC Bioinformatics. 2016 May 17;17(1):214(JCR二区,与电气学院郑春厚教授合作)

    18. 夏俊峰 Ge SG, Xia J, Sha W, Zheng CH. Cancer Subtype Discovery Based on Integrative Model of Multigenomic Data. IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform. 2016 Oct 26. [Epub ahead of print](JCR三区,与电气学院郑春厚教授合作)

    19. 夏俊峰 Yue Z, Li HT, Yang Y, Hussain S, Zheng CH, Xia J, Chen Y. Identification of breast cancer candidate genes using gene co-expression and protein-protein interaction information. Oncotarget. 2016 Jun 14;7(24):36092-36100(JCR一区,与生科院陈彦教授合作,共通讯作者)

    20. 夏俊峰 Heist RS, Shim HS, Gingipally S, Mino-Kenudson M, Le L, Gainor JF, Zheng Z, Aryee M, Xia J, Jia P, Jin H, Zhao Z, Pao W, Engelman JA3, Iafrate AJ4. MET Exon 14 Skipping in Non-Small Cell Lung Cancer. Oncologist. 2016 Apr;21(4):481-6.(JCR二区,与美国范德堡大学合作)

    21. 陈鹏 Chen P, Hu S, Zhang J, Gao X, Li J, Xia J, Wang B. A Sequence-Based Dynamic Ensemble Learning System for Protein Ligand-Binding Site Prediction. IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform. 2016 Sep-Oct;13(5):901-912(JCR三区,第一作者)

    22. 陈鹏 Peng Chen, ShanShan Hu, A Random Projection Ensemble Approach to Drug-Target Interaction Prediction, Lecture Notes in Computer Science,2015, 693-699(EI,第一作者)

    23. 陈鹏 ShanShan Hu, Peng Chen, Prediction of hot spots based on physicochemical features and relative accessible surface area of amino acid sequence, Lecture Notes in Computer Science,2016, 422-431(EI,通讯作者)

    24. 陈鹏Wang B, Shen H, Fang A, Huang DS, Jiang C, Zhang J, Chen P. A regression model for calculating the second dimension retention index in comprehensive two-dimensional gas chromatography time-of-flight mass spectrometry. J Chromatogr A. 2016 Jun 17;1451:127-   34.(JCR二区,通讯作者,与上海同济大学合作)

    25. 李长润 张部昌 Changrun Li, Yansheng Wang, Guopai Xie, Bing Peng, Baonian Zhang, Wei Chen, Xunduan Huang, Hang Wu, Buchang Zhang*. Complete genome sequence of Clostridium butyricum JKY6D1 isolated from the pit mud of a Chinese flavor liquor-making factory. J Biotechnol. 2016, 220: 23-24. (JCR二区,第一作者)

    26. 李长润 Pan Pan Guo, Jie Ying Au Yong, Yan Ming Wang and Chang Run Li.2016. Sec15 links bud site selection to polarised cell growth and exocytosis in Candida albicans. Scientific Reports ,6:26464; doi: 10.1038/srep26464.(JCR二区,通讯作者)

    27. 陶清萍, 曹诚, 张部昌*, 刘萱. 利用凝胶过滤层析技术分离人源γ-微管环形复合物. 军事医学, 2016, 40(7): 545-548.

    28. 陈泽良, 高婷, 张部昌*, 曹诚. 应用酵母双杂交技术筛选与埃博拉病毒VP24、VP35、VP40蛋白相互作用的宿主蛋白. 生物技术通讯, 2016, 27(3): 308-313.

    29. 彭兵,祝熙,李忠奎,张宝年,程伟,陈兴杰,谢国排,杨牢记,黄训端,张部昌.窖泥高产己酸菌分离鉴定及培养条件优化的研究[J]. 中国酿造, 2016(已录用)

    30. 杨牢记,宾艳南,徐敏锐,陈兴杰,谢国排,张宝年,程伟,黄训端,张部昌.内标法和外标法在测定己酸菌发酵液己酸含量中的应用[J].酿酒科技,2016(已录用);

    31. 马玉磊,吴攀攀,李忠奎,祝熙,谢国排,张宝年,程伟,陈兴杰,杨牢记,黄训端,张部昌.浓香型白酒人工窖泥培养过程中酸、酯变化规律研究[J].酿酒2016(已录用)

    (二) 发明专利

      1、 新申请发明专利

    (1) 朱林、周琴、韩倩倩、戴维•威孚、张部昌、徐昌志、李萌、王萌抗uPAR抗原的人源化抗体H5L5及其应用。

   (2)戴维•威孚、鲁亚芳、张部昌、徐昌志、朱林、王萌、李萌抗uPAR抗原的人源化抗体H2BL2及其应用。

   (3)抗CD20抗原的抗体L3H3及其应用。 张部昌、朱林、戴维•威孚、曹诚、靳彦文、于庆卓、汪苏曼。(实审阶段,申请专利号:201510924966.9)

   (4)戴维•威孚、王淑敏、朱林、靳彦文、曹诚、张部昌、汪苏曼、于庆卓。一株重组细胞及其在制备人表皮癌治疗药物中的应用。(实审阶段,申请专利号:201610021187.2)

   (5)张部昌,黄训端,陈兴杰,彭兵,马玉磊,杨牢记,谢国排,张宝年,程伟,李长润,汪焰胜,宾艳南,徐敏锐,吴攀攀. 一株克氏梭状芽胞杆菌JZZ及其应用[P]. 申请号:201610137347.X.

   (6)黄训端,张部昌,陈兴杰,祝熙,董宏,谢国排,彭兵,马玉磊,张宝年,杨牢记,程伟,丁鹏飞,王明才,徐亚磊.一种人工窖泥的制备方法[P]. 申请号:201610137348.4.

     2、2016年获得授权的专利

   (1)张部昌, 刘敬涛, 吴杭, 袁莉. 通过糖多孢红霉菌SACE_7301基因途径提高红霉素产量. 申请人: 安徽大学, 专利号: ZL201310082765.X

   (2) 张部昌, 吴攀攀, 吴杭, 朱林. 一种通过糖多孢红霉菌SACE_3986基因提高红霉素产量的方法. 申请人: 安徽大学, 专利号: ZL201410014348.6

   (3) 张部昌, 范伟, 朱晨曦, 许德宏, 广业贵, 刘增武, 孙钧, 方玉明, 江明星, 鲁中宝, 程兴, 陈宇. 一种利用化学酯交换法制备类可可脂的方法. 申请人: 安徽康尔美油脂有限公司, 安徽大学; 专利号: ZL201310461309.6

   (4)张部昌, 范伟, 黄训端, 罗银倩, 许德宏, 广业贵, 刘增武, 孙钧, 方玉明, 江明星, 鲁中宝, 周三长, 程兴. 一种月饼专用油脂及其制备方法. 申请人: 安徽康尔美油脂有限公司, 安徽大学; 专利号: ZL 2013 1 0461072.1

  (5)戴维•威孚, 曹诚, 靳彦文, 米歇尔•瑞奇韦兹, 张部昌, 朱林, 贾茹, 姚溢, 温重政. 抗CD20抗原的抗体L1H1及其应用. 专利授权号:201410121092.9

  (6)戴维•威孚, 王相芳, 曹诚, 靳彦文, 米歇尔•瑞奇韦兹, 张部昌, 朱林, 贾茹, 姚溢. 抗CD20抗原的抗体L4H6及其应用. 专利授权号:201410122716.9

  (7)戴维•威孚 ; 曹诚 ; 靳彦文 ; 米歇尔•瑞奇韦兹 ; 张部昌 ; 朱林; 贾茹. 抗CD20抗原的抗体L4H5及其应用. 专利授权号:201410119482.2

  (8)戴维•威孚 ; 杨凌 ; 曹诚 ; 靳彦文 ; 米歇尔•瑞奇韦兹 ; 张部昌; 朱林 ; 贾茹 ; 姚溢. 抗CD20抗原的抗体L5H6及其应用. 专利授权号:201410120367.7

   (三)省级科技成果

   (1)方庆敏、高佳佳、卢国权、马腾飞、杨兴元、王坤友。动植物调和油脂的研制与产业化。16328

   (2)张部昌、陈兴杰、黄训端、杨红文、杨牢记、彭兵等。金种子高产己酸菌Clostridium kluyveri JZZ。16-248-16


   

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